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      Neosuite TCMD 首頁產品中心Neosuite TCMD

      產品名稱(英文):Neosuite TCMD

      產品名稱(中文):中藥化學數據庫

      軟件廠家:NeoTrident

      PDF介紹 :點擊下載

      產品簡介:

      (Traditional Chinese Medicine Database, NeoSuite) 中藥新產品開發和現代化研究的綜合信息源,采用國際規范的信息表達體系全面定義了中英名稱,化學結構,各類數值,生物活性等數據。目前該庫收集化合物23,033種,其中8000種成分有藥理數據。

      • 產品詳情
      • 常見問題
      (Traditional Chinese Medicine Database, NeoSuite)
            創騰科技有限公司和中科院過程工程研究所分子設計課題組聯合開發的綜合性中藥化學數據庫。TCMD數據庫是在中藥研究者長期從事藥物設計方法研究的背景下,對數據庫工具的國內外需求進行分析,經多年努力研制成功的科學數據庫產品,是一個支持新藥研發和中藥現代化研究的新型工具。TCMD數據目前收集了中藥化合物23033種,每種中藥化合物包含下列11項數據:唯一代碼、CAS登錄號、中文名稱、英文名稱、分子式、分子量、二維結構式、植物來源、藥理活性(即藥理模型實驗結果,近8000多種化合物有此數據)、物理化學性質(晶體形態、熔點、沸點、旋光度等,14000多種化合物有此數據)和參考文獻。TCMD數據庫涉及到的中藥藥用植物有6735種,使用的參考文獻有5538多篇。

      產品介紹
           中藥化學數據庫(Traditional Chinese Medicines Database,TCMdb)是中科院過程工程研究所分子設計課題組在長期從事藥物設計方法研究的背景下,對數據庫工具的國內外需求進行分析,經多年努力研制成功的科學數據庫產品,是一個支持新藥研發和中藥現代化研究的新型工具。

           TCMdb是一個多學科交叉的科學數據庫,涉及中藥現代化研究、中藥化學、藥物化學、植物化學、化學信息學、中藥藥理學、分子藥理學、藥物設計學、天然產物研究與開發、新藥創制、新劑型中藥研發、新農藥及其它農用化學品的研發等諸多研究及開發領域。

            TCMdb中包含了23033種化合物,涉及中藥藥用植物6735種,使用參考文獻5538篇。每種化合物下列12項數據:唯一代碼、CAS登錄號、中文名稱、英文名稱、別名、分子式、分子量、二維結構式、植物來源、藥理活性(即藥理模型實驗結果,近8000多種化合物有此數據)、物理化學性質(晶體形態、熔點、沸點、旋光度等,14000多種化合物有此數據)和參考文獻。

       

      產品特點

       • 8000種成分有藥理數據:200種細胞水平抗癌模型;細胞因子網絡調節機制抗炎模型;各種抗氧化模型;各種酶抑制劑模型;NO抑制劑模型等等。

       • 信息表達體系完整嚴格:按國際規范全面定義了中英名稱、化學結構、各類數值、生物活性等數據結構、層次及格式,使相關學科信息表達和國際接軌。

       • 保證數據一致性可靠性:采用多種交叉驗證方法保證信息準確可靠?;衔锪Ⅲw化學表達完整,并首次實現了藥理數據多層次結構規范化。

           無論您是從中藥設計新西藥,還是研發新劑型新中藥,都可以把TCMdb中藥數據庫作為一種得力的工具,幫助您以最快速度分析并做出決策,解答任何與中藥有關的問題:
       

       • 有多少化學成分做過抗癌實驗,哪些有活性?哪些沒有?IC50值多少?

       • 以心血管藥物為研發目標的公司應該關注哪些中藥的研發動態?

       • 從中藥出發創制抗高血壓新藥,哪些資源成功希望最大?

       • 黃酮類化合物有多少種藥理活性?哪些活性最強?哪些活性譜最廣?

       • 中藥傳統藥效有清熱、安神、解表、活血等,對應的藥理學概念是什么?

       

      應用實例

      • 從植物檢索化合物
      給定一種中藥藥用植物,問該種植物都含有哪些化合物? 嚴格的說法是:都有哪些化合物被從該種植物中分離并進行了結構確定?TCMdb 數據庫能方便地完成這個任務。以三七為例,單擊菜單欄下方的“Query”按鈕,在query 模式下激活“植物來源”域,鍵入“Like “% 三七%””時,單擊菜單欄“Search”按鈕,單擊下拉菜單中的“By Form”,系統將擴展地檢出各種三七中含有的全部化合物,包括竹節三七等。

      類別

      方式

      檢索域

      鍵入

      命中數

      注解及說明

      單項

      SBF

      植物來源

      Like “%人參%”

      187

      檢出各種人參中含有的全部化合物

      單項

      SBF

      植物來源

      Like “%三七%”

      161

      檢出各種三七中含有的全部化合物,注意包括竹節三七等

       

      • 化合物藥理活性數據檢索

      在全庫的23033 種化合物中,8000 種化合物有藥理活性數據。這是研究QSAR/SAR 關系的珍貴信息。用SBF 方式,激活“藥理活性”域后,鍵入“Like “% 藥理關鍵字%”,之后單擊菜單欄“Search”按鈕,單擊下拉菜單中的“By Form”,就得到下表中的結果。亦可采用QB 方式,見下表中中間的三個例子:

      類別

      方式

      檢索域

      鍵入

      命中數

      注解及說明

      單項

      SBF

      藥理活性

      Like "%金黃色葡萄球菌%"

      433

      433個化合物有抗金黃色葡萄球菌數據

      單項

      SBF

      藥理活性

      Like "%細胞毒%"

      2523

      2523個化合物有體外抗腫瘤數據

      單項

      QB

      藥理活性

      Activities like "%抗腫瘤%"

      637

      637個化合物有體內抗腫瘤數據

      單項

      QB

      藥理活性

      Activities like "%抗高血壓%"

      219

      219個化合物有抗高血壓數據

      單項

      QB

      藥理活性

      Activities like "%抗腫瘤%" or Activities like "%細胞毒%"

      2920

      2920個化合物有體外或體內抗癌數據

      單項

      SBF

      藥理活性

      Like “%抗瘧%”

      250

      250個化合物有抗瘧數據

      注意: 體外抗癌活性在庫中的規范表達方式是“細胞毒”,體內抗癌活性在庫中的規范表達方式是“抗腫瘤”。觀察化合物生物活性索引中的生物活性規范表達方式對于熟練使用數據庫是有好處的。

       

      • 抑制劑及其藥理模型檢索

      用SBF 方式,激活“藥理活性”域,鍵入“like "% 抑制劑%"”命令,單擊菜單欄“Search”按鈕,單擊下拉菜單中的“ByForm”,檢出各種抑制劑1724 種。進一步用子庫查詢方法,可檢出特指的抑制劑,如血小板聚集抑制劑242 種。再進一步,用子庫查詢方法可檢出不同的藥理模型的數據,如能抑制花生四烯酸誘導的血小板聚集的化合物95 種,能抑制膠原誘導的血小板聚集的化合物75 種,等,詳見下表:

      類別

      方式

      檢索域

      鍵入

      命中數

      注解及說明

      單項

      SBF

      藥理活性

      ike "% 抑制劑%"

      1724

      檢出各種抑制劑1724 種

      單項

      SBF,
      current list

      藥理活性

      like "% 醛糖還原酶抑制劑%"

      93

      檢出醛糖還原酶抑制劑93 種

      單項

      SBF,
      current list

      藥理活性

      like "% 血小板聚集抑制劑%"

      242

      檢出血小板聚集抑制劑242 種

      子庫查詢

      SBF,
      current list

      藥理活性

      like "% 花生四烯酸%"

      92

      其中花生四烯酸誘導的92 種

      子庫查詢

      SBF,
      current list

      藥理活性

      like "% 膠原%"

      74

      其中膠原誘導的74 種

      子庫查詢

      SBF,
      current list

      藥理活性

      like "%PAF%"

      58

      其中PAF 誘導的58 種

      子庫查詢
      SBF,
      current list
              藥理活性 like "% 凝血酶%"       57 其中凝血酶誘導的57 種

       

       結構檢索
           結構及子結構檢索是TCMdb 特有的功能。這一功能的實現對進行QSAR 研究,進而研發新藥提供了巨大的幫助。這里只舉出最簡單的例子:將黃酮類化合物的特征分子骨架放入SBF 方式下的structure 檢索域,從庫中檢出包含黃酮骨架的化合物1101 個。用β-D- 葡萄糖的分子骨架( 含確切的立體化學信息) 提問,得到4438 個命中化合物。其它例子見下表:

      類別

      方式

      檢索域

      鍵入

      命中數

      注解及說明

      單項

      SBF

      二維結構

              1101

      黃酮類化合物1101

      單項

      SBF

      二維結構

      432

      二氫黃酮類化合物432個

      單項

      SBF

      二維結構

      566

      香豆素類化合物566個

      單項

      SBF

      二維結構

      79

      洋地黃毒強心甙79個

      單項

      SBF

      二維結構

      4438

      含β-D-葡萄糖化合物4438個

      • 用戶評價
           TCMdb中藥數據庫和科學出版社發行書籍《中藥原植物化學成分集》基本相同,但文字/數值/結構復合型數據庫具有任何紙質書本不可能具有的強大檢索功能,和《中藥原植物化學成分集》配合使用,相得益彰,是完美的結合。國內專家對《中藥原植物化學成分集》一書的評論摘要如下:

          “該書為中藥的現代化研究搭建了一個很好的信息平臺,達到了國際上同類工作的先進水平”(醫科院藥用植物所肖培根院士)

           “該書內容豐富,資料完整,反映了國內外最新研究成果,對于充分利用我國中藥資源,促進中藥現代化研究,提升我國創新藥物研究水平,具有重要的科學價值“(中國藥理學會杜冠華理事長)

            “該書為用綜合方法系統研究中藥首次提供了一套兩萬種以上中藥化學成分的數據集合……在理論層面上對臨床實踐有重要參考價值”(中醫科學院翁維良首席研究員)

       

      數據收集評價和庫研制:NiceData北京翔實達特軟件研究開發中心
      軟件開發及數據庫發行:NeoTrident創騰科技有限公司

       

       

      產品咨詢:

      021-51821768轉219 (滬辦)

      010-82676188轉213 (京辦)

      ? 問:Neosuite TCMD能否進行結構搜索?

           答:結構及子結構檢索是Neosuite TCMD中文版特有的功能。這一功能的實現對進行QSAR研究,進而研發新藥提供了巨大的幫助。

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